מאחר וכמעט כל פעולה שהאדם עושה משלבת עבודה של מספר מערכות גופניות בו זמנית, חיפוש גורם הקושי יתמקד במערכות הגוף השונות וביכולת האינטגרטיבית להפעיל מספר מערכות בו-זמנית.

המערכות הנבדקות והגורמים לקשיי תפקוד שונים הם:

• מערך השליטה הרצונית והמודעת ביכולת התנועה של שרירי העיניים - מצב לא תקין יגרום לקשיי קריאה, קושי בהתמצאות במרחב, התקלות בחפצים ועוד. קושי במערכת עלול לגרום לסחרחורות, בחילות, חוסר שיווי משקל ועוד.
• תפקוד מערך קשר מוח-עין-יד - מצב לא תקין יקשה על כתיבה ומגוון פעולות הדורשות דיוק.

• מערך המוטוריקה העדינה - מצב לא תקין יגרום לקשיים ולעייפות בכתיבה ובכל מטלה הדורשת הפעלת אצבעות הידיים לאורך זמן כגון גזירה, קיפול, קשירת שרוכים ועוד.
• יכולת גרפומוטורית – מצב לא תקין יתבטא בעיקר בקשיי כתיבה וציור.
• מערך המוטוריקה הגסה ומערכת ההצלבה – מצב לא תקין יפריע במגוון פעילויות ספורטיביות. כאשר מערכת ההצלבה לא תקינה תהיינה השפעות גם על כתיבה בכתב ראי.
• יכולת חציית קו האמצע של הגוף – מצב לא תקין ישפיע על מגוון פעולות שקשורות במערכת ההצלבה.

היפר/היפו רגישות חושית
ניתן להצביע על היבטים שונים של יתר או חסר ברגישות חושית המשפיעים על התפקוד:

• רגישות יתר למגע (טקטילי) – רגישות יתר למגע קל או עדין יגרום לילד להימנע מליטופים עדינים, להתרחק מילדים אחרים, להירתע ממגוון חומרים, שגורמים לרגישות (חול, דשא, בדים מסוימים, טקסטורות מסוימות, חומרי ניקוי למיניהם וכו').
  היפו רגישות למגע קל יגרום לילד להתחכך הרבה ולחפש מגע חזק ומשפשף. יתכן שיגע הרבה בעצמו או יתחכך בטקסטורות שונות ובאנשים אחרים.
• רגישות למגע עמוק (פרופריוצפטיבי) – היפר רגישות למגע עמוק עלול לגרום למגע להיות כואב. עלול לגרום לילד שלא ירצה חיבוקים או עיסויים, לנוע בישיבה ללא הפסקה. ימנע מקרבה גופנית לאנשים. היפו רגישות למגע עמוק תגרום לילד להתנהג באגרסיביות עד כדי לזרוק עצמו אל הקיר, לחפש מריבות ומכות עם ילדים אחרים, להתגושש בכל הזדמנות אפשרית.
• רגישות בטעם – היפר רגישות בטעם תגרום לילד להימנע מסוגים רבים של מזון, לאכול מזונות מסוימים בלבד לאורך זמן, להגיב בחריפות למזון בעל מרקם שאינו נעים לו בפה.
• רגישות בריח – עלולה לגרום לתגובות אוטונומיות (סחרחורת, בחילה, כאבי ראש, דופק לב מואץ, הזעת ייתר כו') ולתגובות רגשיות חזקות לריחות שונים.
• רגישות בשמיעה – עלולה לגרום לקשיי ריכוז החשיבה בכל מקום בו קיימים רעשים חלשים ומשתנים כבכיתה, להתרחק ממקומות הומי אדם, יכולים לפחד מרעשים חזקים, להסתגר חברתית ועוד. הילד עלול להפעיל מוסיקה חזקה מאד כדי להחליש את כל מקורות הרעש האחרים.
• רגישות בראיה – מתבטאת בדרך כלל ברגישות לאור מסוגים שונים.